Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt23Q99PS0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt23Q99PS0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt23Q99PS0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt23Q99PS0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt23Q99PS0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt23Q99PS0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt23Q99PS0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt23Q99PS0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms