Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrbp1Q99PL5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms