Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cep41Q99NF3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cep41Q99NF3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms