Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms