Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.6 ms