Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms