Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms