Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms