Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms