Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms