Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms