Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms