Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clint1Q99KN9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clint1Q99KN9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clint1Q99KN9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clint1Q99KN9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clint1Q99KN9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Clint1Q99KN9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Clint1Q99KN9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clint1Q99KN9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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