Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ciao1Q99KN2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ciao1Q99KN2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms