Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms