Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf11Q99JX1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms