Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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