Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms