Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk9Q99J95 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms