Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms