Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu1Q99J10 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms