Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbox1Q924Y0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbox1Q924Y0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbox1Q924Y0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbox1Q924Y0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbox1Q924Y0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbox1Q924Y0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbox1Q924Y0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bbox1Q924Y0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms