Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms