Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms