Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Odf3Q920N1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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