Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Med28Q920D3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Med28Q920D3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Med28Q920D3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Med28Q920D3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Med28Q920D3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Med28Q920D3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Med28Q920D3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Med28Q920D3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med28Q920D3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Med28Q920D3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med28Q920D3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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