Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms