Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms