Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rnf130Q8VEM1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf130Q8VEM1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms