Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul7Q8VE73 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul7Q8VE73 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms