Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtbQ8VD33 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms