Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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