Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApobrQ8VBT6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms