Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmx1Q8VBT0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms