Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms