Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc12Q8R344 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms