Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim29Q8R2Q0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms