Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Vmn1r200Q8R281 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Vmn1r200Q8R281 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Vmn1r200Q8R281 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Vmn1r200Q8R281 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Vmn1r200Q8R281 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Vmn1r200Q8R281 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Vmn1r200Q8R281 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Vmn1r200Q8R281 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r200Q8R281 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Vmn1r200Q8R281 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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