Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms