Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Colec12Q8K4Q8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms