Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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