Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Lrrtm1Q8K377 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Lrrtm1Q8K377 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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