Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms