Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms