Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sde2Q8K1J5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms