Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms