Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CIL4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CIL4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms