Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Prmt5Q8CIG8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms