Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms