Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms